Brendonas Stakauskas
Padalinys: Išmaniųjų technologijų tyrimų grupė
Pareigos: doktorantas
Kryptis: informatikos inžinerija
Dirba: Akademijos g. 4, 612 kab., Vilnius
Elektroninis paštas:
Doktorantūros studijos
Preliminari tema Giliais neuroniniais tinklais grįstų mašininio mokymo metodų taikymas viruso mutacijų trajektorijai prognozuoti
Vadovas prof. dr. Virginijus Marcinkevičius
Studijų laikas 2022 10 01–2026 09 30
Pranešimai mokslinėse konferencijose
Ataskaitinė Informatikos inžinerijos ir Informatikos krypčių doktorantų konferencija, 2023 m. kovo 21 d., Vilnius „Giliais neuroniniais tinklais grįstų mašininio mokymo metodų taikymas viruso mutacijų trajektorijai prognozuoti“ (skaidrės)
Poster B. Stakauskas "Comparison of Phylogenetic Inference Methods Accuracy Using SARS-CoV-2 Data", 20th IEEE Conference on Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology, 2023 Rugpjūčio 29-31, Eindhoven, Netherlands
Poster B. Stakauskas "Visualising SARS-CoV-2 Evolutionary Space Using Protein Language Models", European Conference on Machine Learning and Practice of Knowledge Discovery in Databases, 2024 Rugsėjo 9-13, Vilnius, Lietuva
Poster B. Stakauskas, V. Marcinkevičius "Visualising SARS-CoV-2 Evolutionary Space Using Protein Language Models", 17th conference of Data Analysis Methods for Software Systems, 2024 Lapkričio 28-30, Druskininkai, Lietuva
Poster B. Stakauskas, V. Marcinkevičius "Dimensionality Reduction of Protein Language Model Embeddings for Viral Clustering", 34th International Conference on Artificial Neural Networks, 2025 Rugsėjo 9-12, Kaunas, Lietuva
Moksline produkcija
Stakauskas, B., & Marcinkevičius, V. (2026). Evaluating Protein Language Model Embeddings for Viral Clade Assignment. Journal of Computational Biology, 33(7), 733–743. https://doi.org/10.1177/15578666261443336
Stakauskas, B., & Górecki, P. (2026). Analysis of phylogenetic signal in protein language model embeddings. Scientific Reports, 16(1). https://doi.org/10.1038/s41598-026-57699-5