2011

1. Besson, J., Medvedev, V., Lupeikiene, A. (2011). Comparing Real and Intended System Usages: A Case for Web Portal. Informatica. 2012, Vol. 23 (2), 191–201.
2. Čaplinskas, A., Lupeikienė, A., Paliulionienė, L. (2011). Internetinių paslaugų paieškos technologijų vertinimas jų tinkamumo internetinei prekybai požiūriu. Informacijos mokslai, Vilnius: Vilniaus universiteto leidykla, T. 56, 85-97.

2010

1. Besson, J., Mitašiūnaitė, I., Lupeikienė, A., Boulicaut, J.-F. (2010). Comparing Intended and Real Usage in Web Portal: Temporal Logic and Data Mining. Proceedings, Editors : Witold Abramowicz, Robert Tolksdorf. Book Series: Lecture notes in business information processing. Business Information Systems, 13th International Conference (BIS 2010), Berlin, Germany, May 3-5, Berlin: Springer, Vol. 47 , 83-93.
2. Besson, J., Mitašiūnaitė, I., Lupeikienė, A., Boulicaut, J.-F. (2010). Comparing intended and real usage in web portal: temporal logic and data mining. Business information systems : 13th international conference, BIS 2010 : Berlin, Germany, May 3-5, 2010 : proceedings. Berlin ; Heidelberg : Springer, p. 83-93.

2009

1. Lupeikienė, Audronė; Čaplinskas, Albertas; Dzemyda, Gintautas, Problems of portal users behaviour specification / Lietuvos matematikos rinkinys. Lietuvos matematikų draugijos darbai. T. 50 (2009), p. 380-385.
2. Bagušytė Lina, Lupeikienė Audronė Jungčių aibė organizacijos informacinės sistemos architektūrai. Lietuvos matematikos rinkinys. Lietuvos matematikų draugijos darbai. T. 50 (2009), p. 351-356.
3. Lupeikienė, Audronė; Bagušytė, Lina, Paslaugų klasifikavimas informacinių sistemų kūrimo kontekste / Informacijos mokslai. T. 50(2009) p. 287-293.
4. Bagušytė, L., Lupeikienė, A. (2009). Hybridization of architectural styles for integrated enterprise information systems. Information systems development : towards a service provision society. New York [etc.]. Springer, p. 471-479.

2007

1. Lupeikienė, Audronė. Teoriniai ir technologiniai informacinių sistemų aspektai : vadovėlis informatikos krypties doktorantams ir magistrams / Vilnius: Matematikos ir informatikos institutas, "Mokslo aidai", 2007. 200 p.
2. Bagušytė, Lina; Tupikov, Dmitrij; Lupeikienė, Audronė. Heterogeninių komponentų jungimas į sudėtinius komponentus: sprendimai ir jų realizavimas / Informacinės technologijos 2007 : konferencijos pranešimų medžiaga. Kaunas: Technologija, 2007, p. 167-171.
3. Bagušytė, Lina; Lupeikienė, Audronė. Komponentinė informacinės sistemos dekompozicija / Lietuvos matematikos rinkinys. T. 47, spec. Nr. (2007) p. 149-154.
4. Bagušytė, Lina; Lupeikienė, Audronė, Verslo ir informacinių sistemų integravimas: architektūrinis aspektas Informacijos mokslai . T. 42-43(2007) p. 155-161.
5. Lupeikiene A. Integrated Enterprise Information Systems: Thinking in Component Concepts. Databases and Information Systems IV. Selected Papers from the Seventh International Baltic Conference DB&IS'2006 , O. Vasilecas, J. Eder, A. Caplinskas (eds.), IOS Press, 2007, ISSN 0922-6389, pp.203-215.

2006

1. Lupeikienė, A. Integrated enterprise information systems: thinking in component concepts / Frontiers in artificial intelligence and applications. Vol. 155, Databases and information systems IV : selected papers from the Seventh international Baltic conference DB&IS’2006. Amsterdam ... [ p. 203-215.
2. Lupeikiene A. Integrated Enterprise Information System Development through Component Abstraction. In Proceedings of the Seventh International Baltic Conference on Databases and Information Systems, O. Vasilecas, J. Eder, A. Caplinskas (eds.), Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2006, 168-174.
3. Bagušytė, Lina, Lupeikienė, Audronė. Organizacijų integruotų informacinių sistemų komponentinio kūrimo problemos Informacinės technologijos 2006 :konferencijos pranešimų medžiaga / Kauno technologijos universitetas. T. 1. Kaunas : Technologija, 2006 p. 183-188.

2005

1. Giedrimas, Vaidas; Lupeikienė, Audronė. Komponentinių programų struktūrinės sintezės teorinės problemos. Lietuvos matematikos rinkinys, 45 (spec.nr.), 2005, 139-143.
2. Bagušytė, Lina; Lupeikienė, Audronė. Programinio komponento ontologijos formalioji specifikacija. Lietuvos matematikos rinkinys, T.45, spec. Nr. (2005), 113-118.
3. Lupeikiene, A.; Giedrimas, V. Component model and its formalisation for structural synthesis. Scientific Proc. of Riga Technical University. Computer Science, 22, 2005, 169-180.
4. Bagušytė, Lina; Lupeikienė, Audronė. Programinio komponento ontologija ir jos sudarymas. Informacijos mokslai, Vilnius: Vilniaus universitetas, 2005, 34, pp. 119-124.

2004

1. Lupeikienė, Audronė; Giedrimas, Vaidas. Komponento specifikacijos formalizavimas. Lietuvos matematikos rinkys, 44 (spec. nr.), 2004, 276-280.

2003

1. Čaplinskas, A.; Lupeikienė, A.; Vasilecas, O. The Role of Ontologies in Reusing Domain and Enterprise Engineering Assets. Informatica. 14(4), 2003, 455-470.
2. Lupeikienė, A., Vasilecas, O.:Žinių valdymas integruotoje verslo, informacinėje ir programų sistemoje. Paskelbta: Informacijos mokslai. 26, 2003, ISSN 1392-0561. Vilnius: Vilniaus universitetas, pp. 141-146.
3. Lupeikienė, A., Vasilecas, O.: Mobilių informacinių sistemų kūrimo ypatumai. Paskelbta: Informacinės technologijos 2003, Konferencijos pranešimų medžiaga. ISBN 9955-09-335-8. Kaunas: Kauno technologijos universitetas, 2003, pp. VI-23 - VI-28. (Ir CD „XXI Amžiaus informacinės technologijos“. ISBN 9955-09-336-6. Kaunas: KTU, 2003).
4. Lupeikienė, A.: Agentinių technologijų panaudojimo reikalavimai kuriant komponentines verslo, informacines ir programų sistemas. Paskelbta: Informacinės technologijos 2003, Konferencijos pranešimų medžiaga. ISBN 9955-09-335-8. Kaunas: Kauno technologijos universitetas, 2003, pp. VI-16 - VI-22. (Ir CD „XXI Amžiaus informacinės technologijos“. ISBN 9955-09-336-6. Kaunas: KTU, 2003).

2002

1. Čaplinskas, A., Lupeikienė, A.. Verslo, informacinių ir programų sistemų projektavimo intelektualizuoto repozitorijaus architektūra. Informacinės technologijos 2002. Konferencijos pranešimų medžiaga. Kaunas: Technologija, 2002, 157-162. (Ir CD „XXI Amžiaus informacinės technologijos“. ISBN 9955-09-336-6. Kaunas: KTU, 2003).
2. Caplinskas, A.; Lupeikiene, A.; Vasilecas, O. Shared Conceptualisation of Business Systems, Information Systems and Supporting Software. In: H.-M. Haav, A. Kalja (eds.). Databases and Information Systems II. Fifth International Baltic Conference "BalticDB&IS'2002", Tallinn, Estonia, June 3-6, 2002, Selected Papers, Dordrecht/Boston/London: Kluwer Academic Publishers, 109-120.
3. Caplinskas, A.; Lupeikiene, A.; Vasilecas, O. Unified Enterprise Engineering Environment: Ontological Point of View. In: H.-M. Haav, A. Kalja (eds.). Databases and Information Systems. Proc. of the Fifth International Baltic Conference "BalticDB&IS'2002", Tallinn, June 3-6, 2002, 1, Tallinn, 2002, 39-50.
4. Caplinskas, A., Lupeikiene, A., Vasilecas, O. (2002). A Framework to Analyse and Evaluate Information Systems Specification Languages. In: Manolopoulos, Y., Navrat, P. (eds.). Advances in Databases and Information Systems. 6th East European Conference, ADBIS 2002, Bratislava, Slovakia, September 2002, Proceedings. Lecture Notes in Computer Science, 2435, Springer, p. 248-262.

2001

1. Čaplinskas, A., Lupeikienė, A.: Sistemų inžinerijos intelektualizavimo problemos. Informacinės technologijos' 2001, Konferencijos pranešimų medžiaga. ISBN 9986-13-826-4. Kaunas: Technologija. 2001, pp. 200-205.
2. Čaplinskas, A., Lupeikienė, A. (2001). Programų, informacinių ir verslo sistemoms kurti naudojamų žinių formalizavimo problemos. Lietuvos matematikos rinkinys, Vilnius: MII, Vol. 41, spec. nr., p. 259-266.

2000

1. Vasilecas, O., Lupeikienė, A. Intelektualiųjų informacinių sistemų įtaka verslo procesams. Paskelbta: "Lietuvos mokslas ir pramonė - Informacinės technologijos '2000", Konferencijos pranešimų medžiaga (Kaunas, 2000m. vasario mėn. 2-3 d.), Sudarytojas B. Paradauskas, Kauno technologijos universitetas, "Technologija", Kaunas, 2000, pp. 347-352.

1999

1. Lupeikienė, A.: Įmonių reinžinerija taikant informacines technologijas. Daktaro disertacija. Socialiniai mokslai, vadyba ir administravimas (03S). Matematikos ir informatikos institutas, Vilnius, 1999.
2. Lupeikienė, A., Vasilecas, O.: Žinių naudojimo ypatumai valdant organizaciją. Paskelbta: "Lietuvos mokslas ir pramonė - Informacinės technologijos'99", Konferencijos pranešimų medžiaga (Kaunas, 1999m. vasario mėn. 3-4 d.), A. Otas, V. Petrauskas, H. Pranevičius, R. Šeinauskas (red.), Kauno technologijos universitetas, "Technologija", Kaunas, 1999, pp. 99-105.
3. Lupeikienė, A.: Organizacinių (verslo) sistemų reinžinerijos metodikų analizė ir vertinimas. Paskelbta: "Lietuvos mokslas ir pramonė - Informacinės technologijos'99", Konferencijos pranešimų medžiaga (Kaunas, 1999m. vasario mėn. 3-4 d.), A. Otas, V. Petrauskas, H. Pranevičius, R. Šeinauskas (red.), Kauno technologijos universitetas, "Technologija", Kaunas, 1999, pp. 204-210.
4. Lupeikienė, A., Vasilecas, O.: Verslo proceso reinžinerija: informacijos ir žinių naudojimo aspektai. Paskelbta: Organizacijų vadyba: sisteminiai tyrimai, 9, 1999, pp. 49-64.

1997

1. Lupeikienė, A.: Informacinių technologijų panaudojimo organizacijos reinžinerijoje koncepcija ir patirtis. Kompiuterininkų dienos'97. Konferencijos medžiaga, Vilnius, 1997, pp. 204-211.
2. Lupeikienė, A., Vasilecas, O.: Modeliavimo formalizmo reikalavimai verslo reinžinerijoje. Konferencijos "Informacinės technologijos'97" pranešimų medžiaga, Kaunas, pp. 13-20.

1996

1. Čaplinskas, A., Lupeikienė, A., Vasilecas, O. (1996). Integrated University Information System as Part of National Information Infrastructure. In: H.-M. Haav, B. Thalheim (eds.). Databases and Information Systems. Proc. of the second international Baltic workshop on databases and information systems. . No. 2, Tallinn, p. 125-135.

1995

1. Lupeikienė, A., Vasilecas, O. (1995). Analogijos panaudojimas organizacijos informacinės systemos kūrime. Lietuvos mokslas ir pramonė. Konferencijos "Informacinės technologijos'95" pranešimų medžiaga", Kaunas, p. 184-190.
2. Lupeikienė, A., Vasilecas, O. (1995). Systemų analizės įtaka organizacijos valdymui. Paskelbta: Tarptautinės konferencijos "Verslas ir vadyba'95" darbai, 1, Vilnius, p. 314-324.
3. Čaplinskas, A., Lupeikienė, A., Markevičius, R., Vasilecas, O. (1995). Universitetų informacinių sistemų integravimas į nacionalines informacines infrastruktūras. "Kompiuterininkų dienos'95". Konferencijos medžiaga, Vilnius, p. 40-44.
4. Čaplinskas, A., Lupeikienė, A., Markevičius, R., Vasilecas, O. (1995). Apie universitetų kompiuterinių informacinių sistemų kūrimo principus. Lietuvos mokslas ir pramonė. Konferencijos "Informacinės technologijos'95" pranešimų medžiaga, Kaunas, p. 278-286.
5. Lupeikienė, A. (1995). The role of analogy in reuse. Informatica, Vol. 6, No. 4, p. 483-496.